1. رئیس کل گمرک ایران، توسط وزیر امور اقتصادی و دارایی منصوب می‌شود و به‌عنوان بالاترین مقام اجرایی گمرک، مسئول اداره امور گمرکی، ارائه پیشنهادات تشکیلاتی و بودجه‌ای، استخدام و جابه‌جایی کارمندان و نمایندگی گمرک در مراجع قانونی است.
2. معاونان گمرک با پیشنهاد رئیس کل گمرک و تأیید وزیر امور اقتصادی و دارایی منصوب می‌شوند.
3. کارکنان گمرک مشمول قانون مدیریت خدمات کشوری هستند و با توجه به اهمیت شغلی، از ضریب (۱٫۲) در جدول حق شغل برخوردارند.

گمرک مجاز است نیروی انسانی خود را بر اساس تخصص و تجربه جابه‌جا کند. هزینه‌های اجرای این قانون از محل درآمدهای گمرک تأمین خواهد شد.